Protein structure search and local structure characterization
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
Protein Structure Alignment Using Maximum Cliques and Local Search
The protein structure alignment problem addresses the question of measuring the degree of similarity, in three–dimensional structure, of two proteins. The representation of each protein using a simple contact map allows the correspondence graph for the protein pair to be generated and the maximum clique within this graph provides a measure of the structural similarity between the two proteins. ...
متن کاملMixed Heuristic Local Search for Protein Structure Prediction
Protein structure prediction is an unsolved problem in computational biology. One great difficulty is due to the unknown factors in the actual energy function. Moreover, the energy models available are often not very informative particularly when spatially similar structures are compared during search. We introduce several novel heuristics to augment the energy model and present a new local sea...
متن کاملA Hybrid Local Search for Simplified Protein Structure Prediction
Protein structure prediction based on Hydrophobic-Polar energy model essentially becomes searching for a conformation having a compact hydrophobic core at the center. The hydrophobic core minimizes the interaction energy between the amino acids of the given protein. Local search algorithms can quickly find very good conformations by moving repeatedly from the current solution to its “best” neig...
متن کاملساختار کلاسهایی از حلقه های z- موضعی و c- موضعی the structure of some classes of z-local and c-local rings
فرض کنیمr یک حلقه تعویض پذیر ویکدار موضعی باشدو(j(r رایکال جیکوبسن r و(z(r مجموعه مقسوم علیه های صفر حلقه r باشد.گوییم r یک حلقه z- موضعی است هرگاه j(r)^2=. .همچنین برای یک حلقه تعویض پذیر r فرض کنیم c یک عنصر ناصفر از (z( r باشد با این خاصیت که cz( r)=0 گوییم حلقه موضعی r یک حلقه c - موضعی است هرگاه و{0 و z(r)^2={cو z(r)^3=0, نیز xz( r)=0 نتیجه دهد که x عضو {c,0 } است. در این پایان نامه ساخ...
the underlying structure of language proficiency and the proficiency level
هدف از انجام این تخقیق بررسی رابطه احتمالی بین سطح مهارت زبان خارجی (foreign language proficiency) و ساختار مهارت زبان خارجی بود. تعداد 314 زبان آموز مونث و مذکر که عمدتا دانشجویان رشته های زبان انگلیسی در سطوح کارشناسی و کارشناسی ارشد بودند در این تحقیق شرکت کردند. از لحاظ سطح مهارت زبان خارجی شرکت کنندگان بسیار با هم متفاوت بودند، (75 نفر سطح پیشرفته، 113 نفر سطح متوسط، 126 سطح مقدماتی). کلا ...
15 صفحه اولذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: BMC Bioinformatics
سال: 2008
ISSN: 1471-2105
DOI: 10.1186/1471-2105-9-349